A Pannónia Nyugdíjpénztár elődje, a VIT Nyugdíjpénztár 1994 decemberében alakult meg. 1995 végén 22 ezer taggal, 2006 végén pedig már 43 ezer taggal rendelkeztek. 2011. május 24-én a VIT Nyugdíjpénztár és a CIG Pannónia Életbiztosító Nyrt. hosszú távú stratégiai megállapodást kötött egymással, és egy névváltozás után a Pannónia Nyugdíjpénztár elnevezéssel jelentek meg a piacon. A Pannónia Nyugdíjpénztár magán nyugdíjpénztárának megszűnése után az önkéntes ágazat önállóan működik tovább.

A Pannónia Nyugdíjpénztárba az alábbi pénztárak olvadtak be az elmúlt években:

2012. április 1-jével a Mobilitás Független Országos Önkéntes Nyugdíjpénztár, 2013 júliusában a XI. kerületi Polgármesteri Hivatal Munkavállalói Nyugdíjpénztárának a beolvadása történt meg, 2015. július 1-jén pedig a QUAESTOR Önkéntes Nyugdíjpénztár olvadt be a Pannóniába. A pénztár vagyona 2016 végén elérte a 103 milliárd forintot, taglétszáma pedig a 35 ezer főt.